Rudolf Brandt nacque nel 1909, di professione commerciante nonostante la sua giovanissima età, grazie all'appoggio di Himmler, raggiunse velocemente il grado di colonnello delle SS.
Fu l'assistente personale di Himmler (Persoenlicher Referent von Reichsfuehrer SS Himmler). In questa veste era al corrente di ogni ordine emanato da Himmler e veniva utilizzato come ufficiale di collegamento.
Gli venne affidata anche la carica di Capo dell'Ufficio Ministeriale presso il Ministero degli Interni. All'interno dei programmi di sperimentazione medica su esseri umani rappresentò una pedina importante tenendo i contatti con i medici e distribuendo i prigionieri destinati alla eliminazione a chi ne facesse richiesta.

Al processo dei medici di Norimberga venne riconosciuto colpevole di aver partecipato alla realizzazione di tutti i tipi di esperimenti condotti nei lager.
Riconosciuto colpevole venne impiccato il 2 giugno 1948 nel carcere di Landsberg.