Architetto dello sterminio (1940-1945)

La guerra diede a Himmler l'opportunità di far diventare realtà il suo programma di "pulizia della razza" attraverso l'eliminazione degli ebrei, degli slavi, delle minoranze etniche e di tutti i "subumani".
Poco dopo l'invasione della Polonia venne nominato "Commissario del Reich per il rafforzamento della germanicità" e gli fu concessa una sostanziale autorità su tutti i territori annessi.
Messosi immediatamente all'opera iniziò l'espulsione di polacchi ed ebrei dalle zone baltiche per sostituirli con coloni tedeschi. Nel 1941 alla vigilia dell'invasione dell'Unione Sovietica il suo potere era incontrastato.

Nel 1943 assommò ai suoi poteri anche quello di Ministro degli Interni ottenendo così il controllo totale della macchina repressiva tedesca.
Di fatto Himmler era divenuto "l'architetto del genocidio" e in numerose occasioni rivendicò a se il compito di sterminare gli ebrei. Compito che gli era stato affidato direttamente da Hitler.
Per metterlo in atto creò gli Einsatzgruppen, le squadre mobili di massacro che sterminarono gli ebrei nei territori russi occupati tra il 1941 ed il 1943.
A partire dal 1942 creò i campi di sterminio in Polonia e Germania nei quali gran parte dell'ebraismo europeo sarebbe stato distrutto.

Quando le speranze di vincere la guerra divennero nulle per la Germania Himmler tentò di intavolare una pace separata con gli angloamericani nella convinzione che il conflitto sarebbe continuato tra sovietici ed occidentali. Per favorire questi negoziati ordinò di interrompere la strage nei campi di concentramento.
Venuto a conoscenza delle trattative condotte da Himmler, Hitler lo destituì. L'ammiraglio Doenitz succeduto a Hitler congedò Himmler.

Dopo la resa della Germania Himmler assunse una falsa identità e tentò la fuga ma venne arrestato dagli inglesi.
Pochi giorni dopo il suo arresto - il 23 maggio 1945 - si suicidò.