Fu particolarmente attivo in Ungheria dove in pochi mesi, tra marzo e novembre, come Plenipotenziario del Reich fu uno dei protagonisti dell'avvio di centinaia di migliaia di ebrei verso Auschwitz.
Il suo capo diretto in questo incarico era Ernst Kaltenbrunner capo dell'Ufficio Centrale per la Sicurezza del Reich (RSHA).

Al termine della guerra si consegnò spontaneamente alle autorità alleate sostenendo di averlo fatto perché altrimenti "altri saranno ritenuti responsabili" (1). Quando il procuratore Kempner gli chiese ciò che pensava del processo, rispose: "in qualità di principale accusato, sono vostro nemico, del genere che si deve eliminare. E' tutto quello che so. Sono un criminale che deve essere condannato a morte". Al che Kempner rispose: "Quel che siete emergerà davanti al tribunale americano" (2).

Personaggio chiave nella storia dello sterminio degli Ebrei europei agì in stretto contatto con Eichmann e i suoi uomini riuscendo a superare tutte le difficoltà diplomatiche che minacciavano di ostacolare la sua missione,
Processato nel 1949 venne condannato a venti anni di prigione.
Nel 1951 a seguito di un provvedimento di clemenza concesso dal generale americano John J. McCloy, venne scarcerato.
Nel 1961 si trovava a Darmstadt dove lavorava per una impresa commerciale.
Morì nel 1977.

1) Interrogatorio di Veesenmayer del 20 agosto 1947, NG-2905

2) Interrogatorio di Veesenmayer del 1° novembre 1947, NG-3691