Il governo militare tedesco in Belgio non perse troppo tempo per appuntare la sua attenzione sugli ebrei.
Tra il 1940 ed il 1942 furono diciotto i decreti - via via sempre più pesanti - che vennero emanati contro gli ebrei.
La prima mossa di Falkenhausen consistette nel cercare la collaborazione delle Autorità belghe. Dopo l'occupazione la burocrazia ministeriale belga aveva continuato a gestire il Paese sotto il profilo amministrativo, i tedeschi trovavano comoda questa situazione ma intendevano far capire chi era il vero padrone.
Il 10 ottobre 1940 Falkenhausen chiese il licenziamento di tutti gli ebrei dalla amministrazione pubblica. Avendo ottenuto un rifiuto proseguì la politica antiebraica per proprio conto. Il 23 ottobre 1940 venne proibita la macellazione delle carni secondo l'uso ebraico. Il 28 ottobre vennero emanati due decreti che stabilivano chi era da considerarsi ebreo e imponevano un censimento. Parallelamente fu proibito agli ebrei di esercitare l'avvocatura, la professione medica e furono imposte le dimissioni agli insegnanti.
Nel maggio 1941 iniziò l'attacco ai patrimoni ebraici. Il 31 maggio venne imposto alle aziende "giudaiche" di registrare la loro situazione finanziaria e, contemporaneamente, venne stabilita una somma massima che ciascun ebreo poteva prelevare mensilmente dal proprio conto corrente bancario.

I tedeschi sapevano in anticipo che lo strangolamento economico degli ebrei non avrebbe portato a grandi guadagni. La Comunità ebraica belga era sensibilimente più povera rispetto a quella olandese. Lo stesso Comando Militare nell'ottobre 1940 aveva scritto in un suo rapporto:
« L'influenza del giudaismo sulla vita economica del Belgio è stata molto ridotta. Ad eccezione dell'industria diamantifera nella regione di Anversa, la partecipazione ebraica all'economia belga non vale la pena di essere menzionata ».
Ciononostante su 7.729 aziende censiete come "giudaiche" 588 furono "arianizzate", 6.388 furono liquidate e 753 al 1° aprile 1943 erano rimaste in sospeso.
Il 29 agosto 1941, con un altro decreto, venne ristretta la libertà di movimento degli ebrei che furono obbligati a risiedere in quattro città (Anversa, Bruxelles, Liegi, Charleroi). Fu anche imposto il coprifuoco dalle 20 alle 7 del mattino.
nel novembre 1941 il Militärbefehlsaber cercò di creare sul modello di ciò che era stato fatto altrove, un Consiglio Ebraico che facilitasse le operazioni di concentramento e deportazione. Il problema principale era dato dal fatto che tutti i dirigenti ebraici erano riusciti a fuggire all'estero. Venne così creata il 25 novembre 1941 l'Associazione degli Ebrei del Belgio. La presidenza venne assunta da Salomon Ullmann che era stato dirigente dei rabbini ebrei dell'esercito belga.